本系以『工業工程學系』之名創立於西元1963年，為大中華區成立最早的相關科系。有鑑於產業環境劇烈變化及科技產業的蓬勃發展，在工業工程的本質與內涵上，省思新世紀工業工程領域發展的新方向與定位，自2001年起正式更名為『工業工程與經營資訊學系』。現有大學部學生400人，研究生近90人(含碩士班、醫務工程與管理碩士在職專班EMHA、博士班)。
本系以培育學生具有「基礎工程」、「國際溝通」、「現代化資訊科技」、「人文素養」、「社會關懷」、「學習新知」、及「知識創新」等能力為目標，培養的學生將為具有積極進取、溝通協調、解決問題、創新能力之領導人才，以期在工業工程、經營管理、資訊系統與工程、自動化生產、健康管理等相關領域成為科技應用、創新及管理之佼佼者或優秀之研究者。
教學與研究重點
工業工程與經營資訊是銜接工程學與管理學兩大領域的一門學科。新世紀的工業工程除保有基礎工業工程的內涵外，亦重視經營管理和資訊應用，因此高中自然或社會組的學生本系皆有招收名額。
本系發展重點與課程規劃包含二大組別：
(1)智慧設計與生產
(2)智慧經營與管理。
課程除與中部產業密切合作外，因應產業全球化趨勢，工業4.0等相關技術 (如工業機器人應用、人工智慧、雲端，以及精實生產均是本系發展重點；此外，醫務工程與管理則為本系與中區醫療院所研究合作建立跨領域的平台。
